Seorang pria misterius meminta Kogoro Mouri untuk pergi ke Yokohama. Dia juga meminta Ran, Conan, dan yang lainnya untuk pergi dengan Kogoro. Tetapi itu adalah sebuah perangkap, dan Ran dan Grup Detektif Cilik dibawa sebagai sandera. Kasus ini, yang diberi oleh pria misterius itu ke Kogoro, harus diselesaikan dalam 12 jam, atau bom, yang dipakai oleh Ran dan yang lainnya, akan meledak. Pelaku tindak kriminal juga mengetahui bahwa Conan adalah Shinichi Kudo. Heiji Hattori dan Kaito Kid juga muncul dalam film ini.