Di alam semesta alternatif ke Clannad anime asli, Okazaki Tomoya berkencan Sakagami Tomoyo di episode 24 dan terakhir dari Clannad. Ketika Tomoyo terpilih Mahasiswa Presiden Dewan, mimpinya untuk menyelamatkan pohon sakura sekolah dari ditebang mulai datang ke hasil. Namun, dia tidak pernah berakhir tugas dan rumor buruk tentang hubungan mereka menyebar dengan sesama siswa karena reputasi Tomoya sebagai tunggakan membuat keretakan antara keduanya. Sebagai Tomoya jam tangan Tomoyo naik lebih tinggi dan lebih tinggi ke kejauhan, hubungan mereka melampaui batas oleh masyarakat yang mengancam untuk memisahkan mereka.