Watanuki Kimihiro bisa melihat roh dan berbagai macam makhluk gaib lainnya, yang cukup mengganggu dia sehingga dia tidak suka dengan kemampuannya. Dalam perjalanan pulang suatu hari, sementara dia terus diganggu oleh beberapa roh, ia secara misterius dipaksa untuk masuk ke sebuah rumah yang aneh. Di sana, ia bertemu Yuuko, seorang wanita misterius yang mengaku dapat menyingkirkan kemampuannya untuk melihat dan menarik makhluk gaib dengan bayaran. Dia minta untuk bekerja padanya “di toko” yang memberikan keinginan kepada orang-orang, dan dengan demikian mulai petualangan Watanuki melalui peristiwa aneh dan indah di toko tersebut.