Himura Kenshin adalah pengembara dengan masa lalu yang gelap dan seorang pembunuh sadis. Bukan ronin tapi Rurouni, ia tidak pernah menjadi seorang samurai, tapi seorang pembunuh dengan keterampilan yang hebat dalam restorasi Meiji. Perjalanannya membawanya ke Tokyo pada tahun ke-11 era Meiji, di mana ia berteman master perempuan Kendo, mantan pencuri, petarung dan dokter semua dengan rahasia mereka sendiri. Bersama-sama mereka melawan musuh yang muncul ke permukaan dari masa lalu gelap yang Kenshin tidak bisa lepas.