Rahasia apa yang tersembunyi dalam Pokemon legendaris Zygarde yang belum pernah terlihat sebelumnya? Fenomena misterius apa yang terjadi pada Satoshi (Ash) dan Gekkouga (Greninja)? Apa tujuan Alain dan Tim Flare, yang menghalangi jalan Satoshi dan teman-temannya? Ketika semua misteri terungkap, bahaya terbesar di wilayah Kalos muncul!