Cerita dari movie ini bertepatan setelah cerita di musim kedua, pada saat pesta perpisahan murid kelas tiga. Karena kelulusan anggota kelas tiga berarti akhir bagi μ’s, kesembilan gadis berkeliling sekolah untuk mengenang kenangan mereka. Tapi, tiba-tiba datang surat kepada mereka, yang membawa mereka ke petualangan yang baru bagi μ’s.