Kegelapan mengikuti siswa SMA Bernama Akihito Kanbara. Meskipun dia berwujud manusia tapi dia adalah setengah Youmu dan Kebal terhadap luka karena bisa regenerasi dengan cepat. Suatu hari Akihito bertemu Mirai Kuriyama saat dia akan melompat dari atap sekolah. Mirai dikucilkan karena kemampuan uniknya untuk memanipulasi darah.Banyak kejadian yang mengganggu mulai terungkap setelah Akihito menyelamatkan Mirai.