Pada akhir zaman Edo, Jepang telah mengalami krisis yang belum pernah terjadi sebelumnya oleh Kurofune (Black Ship), kapal-kapal dari negara-negara asing. Tapi robot raksasa bernama Onigami, yang telah ada sejak jaman kuno, menghilangkan kapal Kurofune. Cerita ini dimulai di Jepang saat restorasi Meiji pada tahun 1868.