Kelanjutan dari Digimon Adventure tri. 3: Kokuhaku. Setelah terjadinya peristiwa Meicoomon yang mengamuk dan Reboot, Taichi dan yang lainnya meninggalkan Meiko yang masih tertekan dan pergi ke dunia digital. Mereka akhirnya kembali bertemu dengan partner digimonnya masing – masing namun sayangnya ingatan para digimon tentang mereka telah hilang akibat peristiwa Reboot. Lalu mereka mencoba untuk menjalin hubungan yang baru, namun yang mendengarkan hanya Biyomon dan memberitahu Sora bahwa dia tidak tahu apa-apa tentang masa lalu yang dibicarakan. Sora yang biasanya lebih memikirkan keadaan teman-temannya dibanding dirinya sendiri kali ini malah tidak tahu harus memikirkan apa lagi karena keadaan ini, Taichi & Yamato pun tidak bisa berbuat apapun.

Meicoomon yang terkena inveksi kembali normal dan muncul dalam keadaan sedih dan hilang kembali, entah kenapa dia masih memiliki ingatan sebelum peristiwa Reboot dan dia mencari Meiko. Setelah melihat Meicoomon, Taichi dan teman temannya memutuskan untuk berpetualang di dunia digital untuk menyelamatkannya namun seseorang dengan kekuatan kegelapan menghalangi mereka. Sementara itu di dunia manusia, Nishijima menyadari bahwa Himekawa telah menghilang. Kerika dia menyelidikinya, dia menyadari bahwa memiliki tujuan tersembunyi dibalik perilakunya selama ini.