Hati gadis-gadis muda yang murni, dan kemudian kekerasan! Mato Kuroi hanya masuk ke SMP, dan pada hari pertama, seseorang menangkap matanya; teman sekelasnya Yomi Takanashi. Kedua bertemu. The polos dan lugu Mato. The Yomi matang. Tampaknya berlawanan, tapi waktu yang mereka habiskan bersama-sama hanya memperkuat persahabatan tumbuh. Tapi saat mereka masuk ke tahun kedua mereka di sekolah, mereka bisa ditempatkan dalam kelas terpisah, dan mereka mulai tumbuh terpisah. Tapi di suatu tempat secara bersamaan. Di dunia lain, seorang gadis muda, api biru yang berada di matanya, Black Rock Shooter menghadapi gadis muda lain; yang satu ini memegang sabit hitam legam, Guru Mati, dan pertempuran sampai mati mulai terungkap.